MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410498860 · doi:10.1128/spectrum.02156-24

One Health study of mobile colistin resistance ( <i>mcr</i> ) in <i>Salmonella enterica</i> in Canada, 2017–2022

2025· article· en· W4410498860 sur OpenAlexaffabout
Ketna Mistry, David Thumbi, Xiao Rui Li, Audrey Charlebois, Brent P. Avery, Anne Deckert, Ashley C. Cormier, Colleen Murphy, Ashley Kearney, Jennifer Campbell, Sara Christianson, David C. Alexander, Sameh El Bailey, Sadjia Békal, Linda Chui, Xiaofeng Ding, Tanis C. Dingle, David Haldane, Linda Hoang, Jessica Minion, Samir N. Patel, George Zahariadis, Céline Nadon, Michael R. Mulvey, Carolee A. Carson, Richard J. Reid‐Smith, Amrita Bharat

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Spectrum · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensSaskatchewan HealthSaskatchewan Health AuthorityGovernment of Newfoundland and LabradorUniversity of CalgaryQueen Elizabeth II Health Sciences CentreUniversity of AlbertaUniversité de MontréalPublic Health OntarioBC Centre for Disease ControlHorizon Health NetworkUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColistinSalmonellaSalmonella entericaMCR-1Drug resistanceMicrobiologyBiologySerotypeMulti drug resistantAntibioticsEnterobacteriaceaeBacteriaGeneEscherichia coliGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Colistin is a last-resort treatment for highly drug-resistant bacterial infections. Of 47,184 Salmonella isolates collected from 2017 to 2022 in Canada from human and animal/food sources, mobile colistin resistance ( mcr ) variants conferring colistin resistance were detected exclusively in humans ( n = 15). These variants were mcr -1.1 ( n = 7), mcr -3.1 ( n = 5), mcr -3.2 ( n = 2), and mcr -1.2 ( n = 1). The most common mcr -containing serotypes were I 4,[5],12:i:- ( n = 8) and Typhimurium ( n = 3). The proportion of Salmonella carrying mcr genes remains low in Canada (0.03%). IMPORTANCE Colistin can be used in combination with other drugs as salvage therapy for extensively drug-resistant infections. If mobile colistin resistance ( mcr ) becomes widely disseminated in Enterobacterales , colistin will no longer be an option for salvage therapy in otherwise untreatable infections. While colistin is not commonly used to treat human Salmonella infections, Salmonella represents an important reservoir of mcr genes that may be transmitted to other gram-negative bacteria. Our aim was to determine the occurrence of mcr genes in Salmonella isolates collected from humans, food animals, and retail meats in Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,696
Score d'incertitude au seuil0,940

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobiology SpectrumMême sujetAntibiotic Resistance in BacteriaTravaux en français237 207