OPHTHALMIC INVOLVEMENT IN SYSTEMIC LUPUS ERYTHEMATOSUS IS ASSOCIATED WITH INTERFERON-ALPHA GENE SIGNATURE: A CROSS-SECTIONAL STUDY
Notice bibliographique
Résumé
PV102 / #625 Poster Topic: AS12 - Genetics, Epigenetics, Transcriptomics Background/Purpose Interferon Pathways studies have highlighted the role of type I interferons, especially interferon-alpha (IFN-α), in driving inflammatory pathways in lupus. Elevated levels of IFN-α are often associated with disease activity. However, few studies have been performed to clarify the role of IFN-α in ocular involvement, including dry eye and retinal changes in Systemic Erythematosus Lupus (SLE). We aimed to assess the association between IFN-α genes signature and ophthalmological involvement in SLE patients. Methods We evaluated patients aged 18 years or older at the Rheumatology unit of Professor Alberto Antunes University Hospital – Federal University of Alagoas, Brazil, who fulfilled 2019 EULAR/ACR criteria for SLE and attended medical routine consultation. A retinal specialist performed Clinical Ophthalmologic evaluation. In this analysis, we excluded eye problems related to treatment, such as cataracts or Hydroxychloroquine retinopathy. We utilized SLEDAI-2K to measure disease activity and blood samples were obtained from patients on the same day of clinical evaluation. Isolation of mononuclear cells (PBMC) and RNA extraction were performed, followed by cDNA synthesis. The expression of the IFI27, IFI44L, IFIT1, ISG15, RSAD2, and SIGLEC1 genes was performed via real-time PCR, using the reference genes RPLP0 and EEF1A1 for normalization. The median of the normalized relative quantity (NRQ) of the genes of each patient was used to calculate the fold change (FC) of the “Interferon Score.” Statistical analysis was performed with GraphPad Prism® 8.0, using the Mann-Whitney test for group comparisons and the Spearman test for correlation analysis. Results The group sample consisted of 38 SLE patients. We identified SLE eye involvement in 57.89% (22/38). Of these, 36.6% (8/22) had lupus retinopathy, 68% (14/22) dry eye, and 18% (4/22) Lupus choroidopathy. 65% of the patients had active disease measured by SLEDAI-2K. We verified higher expression levels of IFN-a gene signature in SLE patients with eye involvement (FC= 2,52 ±1,96; p=0,0027). Conclusions Upregulation of Interferon-alpha genes was observed in SLE patients with ocular involvement, supporting the hypothesis that Interferon-alpha may be an important factor in the inflammatory ophthalmic conditions associated with SLE.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».