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Enregistrement W4410513389 · doi:10.1126/scisignal.adw1245

Technical recommendations for analyzing oxylipins by liquid chromatography–mass spectrometry

2025· review· en· W4410513389 sur OpenAlexafffund
Nils Helge Schebb, Nadja Kampschulte, Gerhard Hagn, Kathrin Plitzko, Sven W. Meckelmann, Soumita Ghosh, Robin Joshi, Julia Kuligowski, Dajana Vuckovic, Marina Tonetti Botana, Ángel Sánchez‐Illana, Fereshteh Zandkarimi, Aditi Das, Jun Yang, Louis Schmidt, Antonio Checa, Helen M. Roche, Aaron M. Armando, Matthew L. Edin, Fred B. Lih, Juan J. Aristizabal‐Henao, Sayuri Miyamoto, Francesca Giuffrida, Arieh Moussaieff, Michael Rothe, Christine Hinz, Ujjalkumar Subhash Das, Katharina M. Rund, Ameer Y. Taha, R. Hofstetter, Markus Werner, Oliver Werz, Astrid S. Kahnt, Justine Bertrand‐Michel, Pauline Le Faouder, Robert Gurke, Dominique Thomas, Federico Torta, Ivana Milic, Irundika H.K. Dias, Corinne M. Spickett, Denise Biagini, Tommaso Lomonaco, Helena Idborg, Jun‐Yan Liu, Maria Fedorova, David A. Ford, Anne Barden, Trevor A. Mori, Paul D. Kennedy, Kirk M. Maxey, Julijana Ivanišević, Héctor Gallart‐Ayala, Cécile Gladine, Markus R. Wenk, Jean-Marie Galano, Thierry Durand, Ken D. Stark, Coral Barbas, Ulrike Garscha, Stacy G. Wendell, Uta Ceglarek, Nicolas Flamand, Julian L. Griffin, Robert Ahrends, Makoto Arita, Darryl C. Zeldin, Francisco J. Schöpfer, Oswald Quehenberger, Randall K. Julian, Anna Nicolaou, Ian A. Blair, Michael P. Murphy, Bruce D. Hammock, Bruce Α. Freeman, Gerhard Liebisch, Charles N. Serhan, Harald Köfeler, P.‐J. Jakobsson, Dieter Steinhilber, Michael H. Gelb, Michal Holčapek, Ruth Andrew, Martin Giera, Garret A. FitzGerald, Robert C. Murphy, John W. Newman, Edward A. Dennis, Kim Ekroos, Ginger L. Milne, Miguel A. Gijón, Hubert W. Vesper, Craig E. Wheelock, Valerie B. O’Donnell

Notice bibliographique

RevueScience Signaling · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEicosanoids and Hypertension Pharmacology
Établissements canadiensInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversity of WaterlooConcordia University
Organismes subventionnairesAgency for Toxic Substances and Disease RegistryNational Institute of Environmental Health SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteInstituto de Salud Carlos IIIMedical Research CouncilNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesMinisterio de Ciencia e InnovaciónBundesministerium für Bildung und ForschungAgencia Estatal de InvestigaciónFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloEuropean CommissionAlzheimer's AssociationCentro de Estudos Ambientais e Marinhos, Universidade de AveiroWellcome TrustDeutsche ForschungsgemeinschaftCenters for Disease Control and PreventionNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaU.S. Department of Agriculture
Mots-clésLipidomicsMass spectrometryChromatographyChemistryLiquid chromatography–mass spectrometryOxylipinBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several oxylipins are potent lipid mediators that regulate diverse aspects of health and disease and whose quantitative analysis by liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) presents substantial technical challenges. As members of the lipidomics community, we developed technical recommendations to ensure best practices when quantifying oxylipins by LC-MS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,060

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0040,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0180,041

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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