MGMT Promoter Methylation Predicts Survival in Lung Adenocarcinoma
Notice bibliographique
Résumé
Lung cancer is the third most common cause of cancer death worldwide. Lung adenocarcinoma (LUAD), its predominant subtype, is particularly lethal due to the delayed diagnosis, variability, and complexity of precision medicine. Although MGMT promoter methylation predicts overall survival in some cancers, it remains unexamined in LUAD. This study assessed whether MGMT promoter methylation predicts survival in LUAD patients. We analyzed 415 primary LUAD samples with the Illumina Infinium Methylation 450K BeadChip. MGMT promoter methylation status was determined using the MGMT-STP27 approach, which relies on two CpG sites. Gene expression data underwent supervised analysis with a limma-based Bioconductor model. Copy number variations (CNVs) were generated via the CONUMEE Bioconductor package for further CNV analysis. The results of all stages showed that MGMT methylated patients' OS after diagnosis (4 years) was significantly shorter than MGMT unmethylated patients' OS (7 years) (p=0.034). The Boxplot result indicated that the MGMT methylated LUAD patient group has a significantly higher aneuploidy score than the unmethylated group (p=0.01). Furthermore, the Kaplan-Meier diagram for the survival probability of the MGMT unaltered group had a longer OS (7 years) than the MGMT altered group (3 years) of LUAD patients for stage 1 to 4 (p=00045). MGMT promoter status is a key prognostic biomarker in LUAD, indicating poorer survival and potentially guiding more aggressive treatment strategies for high-risk patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».