IKBKB gain of function: An inborn error with clinical heterogeneity progressing toward combined immunodeficiency
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The nuclear factor kappa-light-chain enhancer of activated B cells (NF-κB) pathway is a key regulator of immune responses, cell survival, and proliferation. Dysregulation of this signaling pathway is implicated in various human diseases, including inborn errors of immunity. OBJECTIVE: We describe the clinical heterogeneity in 16 patients from 4 unrelated families with missense variants in the kinase domain of IKK2 encoded by IKBKB. METHODS: Genetic variants (p.V203I and p.M65T) in the patients were identified by whole-exome sequencing. An NF-κB reporter assay was performed to investigate NF-κB activity. Extensive immunophenotyping, a lymphocyte proliferation assay, and signaling pathway analysis were performed to gain biological insight into the impact on B- and T-cell phenotype and function. RESULTS: Whole-exome sequencing revealed 2 gain-of-function variants in the IKBKB gene, of which one was a novel variant. While lymphocyte cell numbers are generally normal at young ages, most adult patients exhibit strongly reduced B- and T-cell numbers. Although still normal in their proliferative capacity, B and T cells show defective activation at day 3 (CD70, CD25, and CD40L expression) and impaired B-cell differentiation into plasmablasts. Altered NF-κB signaling was evidenced by phosphoflow experiments. These findings coincide with autoinflammatory skin manifestations, systemic infections with progressive lymphopenia, and potentially fatal diseases occurring later in life. CONCLUSION: This study broadens the clinical spectrum of IKBKB gain-of-function variants as a progressive immunodeficiency in adulthood.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».