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Enregistrement W4410545595 · doi:10.1051/kmae/2025010

IsoFresh: A global stable isotope database of freshwater food webs

2025· article· en· W4410545595 sur OpenAlexaff
Stéphanie Boulêtreau, Chloé Vagnon, Lise Comte, Alban Sagouis, Thomas K. Pool, Rebekah R. Stiling, Chris Harrod, Josie South, Angus R. McIntosh, Marie‐Elodie Perga, Javier Sánchez‐Hernández, Jean‐Marc Roussel, Tyler D. Tunney, Michelle C. Jackson, Julian D. Olden, Julien Cucherousset

Notice bibliographique

RevueKnowledge and Management of Aquatic Ecosystems · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueIsotope Analysis in Ecology
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesInstitut écologie et environnementCentre National de la Recherche ScientifiqueFondation pour la Recherche sur la BiodiversiteUK Research and Innovation
Mots-clésStable isotope ratioEnvironmental scienceDatabaseIsotopeChemistryEnvironmental chemistryBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ecologists seek to understand the ways that human activities are altering the structures and processes that support biodiversity and nature's contributions to people. Food web research at the interface of community and ecosystem ecology is promising in this regard. An industry of studies has utilized stable isotopes in recent decades to rapidly characterize energy and material transfer among organisms in freshwater food webs. Nevertheless, these efforts have been somewhat siloed and mainly locally-based, and lack of a centralized database has limited efforts to tackle questions about food web change using isotopes at a global scale. Here we present IsoFresh, a freshwater food web database that contains species-level carbon (δ13C) and nitrogen (δ15N) stable isotope values for 15343 organisms, representing 1001 food webs and including > 1600 fish species and associated potential prey, from 65 countries around the globe. Our hope is that IsoFresh is used to explore fundamental and applied food web questions, contributing new knowledge about global environmental change so that human societies can better conserve and manage freshwater ecosystems along desirable future trajectories.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0120,010
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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