Diagnosis of Creutzfeldt-Jakob Disease in Canada: An Update on Cerebrospinal Fluid Testing from 2016 to 2024
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Canada's National Microbiology Laboratory offers diagnostic testing of Creutzfeldt-Jakob disease (CJD) and related prion diseases. Since 2016, the highly sensitive and specific end-point quaking-induced conversion assay (EP-QuIC) of CSF samples has been used for antemortem CJD diagnostic testing alongside tests for surrogate biomarkers 14-3-3 and hTau. To assess EP-QuIC's utility, we undertook a retrospective study of Canadian CJD diagnostic testing conducted between 2016 and 2024. METHODS: Using CJD CSF test results collected between 2016 and 2024, we analyzed the CJD incidence in Canada, estimated based on positive EP-QuIC tests. Multivariate regression models were used to further evaluate CJD CSF testing between CJD subtypes, genders, age groups and codon 129 genotypes. RESULTS: From 2016 to 2024, the CJD incidence across Canada was estimated at 1.51 cases per million population per year. CJD incidence did not vary significantly across provinces, although a slight increase in CJD incidence was detected in New Brunswick due to increased sampling rates. EP-QuIC offered higher test sensitivity than both surrogate biomarker tests. Analysis of biomarker abundances and test positivity rates across biochemical subtypes revealed significant differences. We also detected variation in CSF test positivity rates across age groups and a trend of increasing biomarker abundance with age within EP-QuIC-negative cases. No significant variation was detected between males and females. CONCLUSION: EP-QuIC exhibits exceptional specificity and sensitivity for antemortem diagnosis of CJD, providing a valuable tool for the diagnosis of human prion diseases and for improved surveillance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,010 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».