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Enregistrement W4410548594 · doi:10.1093/ndt/gfaf086

Genotype–phenotype correlations and clinical outcomes of genetic <i>TRPC6</i> podocytopathies

2025· article· en· W4410548594 sur OpenAlexaff
Susan McAnallen, Elhussein A. Elhassan, Sinéad Stoneman, Filippo Pinto e Vairo, Marie C. Hogan, Julia Hoefele, Michelle Clince, Poemlarp Mekraksakit, Silvia Titan, Sofía Jorge, Joaquim Calado, Stéphane Decramer, Éloïse Colliou, Stéphanie Tellier, Telma Francisco, Aude Servais, Joséphine Cornet, Jonathan de Fallois, Claire Dossier, Roberta Fenoglio, Alessandra Renieri, Anna Maria Pinto, Sergio Daga, Lorenzo Loberti, Marc Fila, Luís F. Quintana, Francesca Becherucci, Nathalie Guarnizo, Dubrasquet Astrid, B Alawi, Clodagh Sweeney, Michael Riordan, Maria Stack, Atif Awan, Ng Kar Hui, Hugh J. McCarthy, Erik Biroš, Trudie Harris, Kendrah Kidd, Stefanie Haeberle, Anthony J. Bleyer, Andrew Mallett, John A. Sayer, Franz Schäfer, Katherine A. Benson, Emma McCann, Peter J. Conlon

Notice bibliographique

RevueNephrology Dialysis Transplantation · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMusculoskeletal Research Center, Washington University in St. LouisRoyal College of Physicians of IrelandNorthern Counties Kidney Research Fund
Mots-clésMedicineFocal segmental glomerulosclerosisKidney diseaseTRPC6Internal medicineInterquartile rangeRenal functionHazard ratioCohortNephrotic syndromeOncologyKidneyGlomerulonephritis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND HYPOTHESIS: Podocytopathy associated with likely pathogenic/pathogenic variants of Transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 (TRPC6) (TRPC6-AP) has been recognized for about 20 years. As a result of its rarity however, the spectrum of clinical phenotypes and genotype-phenotype correlation of TRPC6-AP remains poorly understood. Here, we characterized clinical, histological and genetic correlates of familial and sporadic patients with TRPC6-AP. METHODS: In this multicentre observational study, an online questionnaire followed by a systematic literature review was performed to create a cohort with comprehensive data on genetic and clinical outcomes [age of onset, clinical presentation, treatment response, kidney biopsy findings and progression to kidney failure (KF)]. Logistic regression, Cox proportional hazards model and Kaplan-Meier analyses investigated the associations between genetic variants and disease progression. RESULTS: Among 87 families (96 familial and 45 sporadic cases), 31 distinct missense TRPC6 variants (including 2 novel) were identified, with c.2683C>T p.(Arg895Cys) and c.523C>T p.(Arg175Trp) the commonest variants. Proteinuric kidney disease/nephrotic syndrome was the most common clinical presentation (83.7%), while focal segmental glomerulosclerosis was the most common histological finding (89.4%). By 33 (interquartile range 17-40) years, 48.9% (69/141) of patients had progressed to KF. Sporadic TRPC6-AP demonstrated an earlier progression to KF than familial cases (P = .001) and were more likely to present with nephrotic syndrome [odds ratio 4.34 (1.85-10.15); P = .001]. Gain-of-function TRPC6 variants were more frequent in familial than sporadic TRPC6-AP (70.8% vs 44.4%; P = .004). Compared with patients with other TRPC6 variants, patients with TRPC6 p.R175W and p.R895C variants progressed to KF earlier [median kidney survival of 21 years, hazard ratio 2.985 (95% confidence interval 1.40-5.79); and 38 years, hazard ratio 1.65 (95% confidence interval 1.01-2.81), respectively, log-rank P = .005]. CONCLUSION: Our study shows unique clinical and genetic correlations of TRPC6-AP, which may enable personalized care and promising novel therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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