The profiles of mammals, birds and fish in twelve water bodies on the Island of Montreal by mitochondrial DNA: detection of invasive animals and meat and fish waste
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The Island of Montreal is composed of a variety of environments, such as undeveloped natural areas, urban parks, and dense residential areas. These environments are home to several types of surface waters, such as ponds, marshes, lakes, streams, and rivers, where some wild animals have adapted. Among them are exotic and invasive animals, which could displace natural animals or endanger people through unwanted interactions. The Montreal Urban Community (MUC) wishes to assess the extent of the presence of exotic or invasive animals in waterbodies on the Island of Montreal to coordinate mitigation measures. Here, I present animal profiles, primarily mammals, birds, and fish, from twelve waterbodies on the Island of Montreal using amplicon sequencing of mitochondrial DNA from environmental DNA. Water samples were collected, and total DNA was extracted. PCR amplifications of a portion of the mitochondrial 16S ribosomal RNA genome were performed with primers designed to primarily target mammals, fish, and birds. After sequencing, the animal lineages and their proportions were determined. Our results showed that invasive animals, primarily fish such as pumpkinseed, common carp or brown bullhead, were detected in high proportions in five water bodies. However, I did not detect any exotic animals. I also detect significant proportions of sequences affiliated with bovine, porcine and several marine fish species, which was unexpected as these animals are not living on the Island of Montreal. Given the commercial or industrial activities surrounding the water bodies, sequences of these unexpected animals are likely related to the release of meat or seafood waste into the water bodies. Our molecular approach is effective for assessing the animal profiles of water bodies. However, caution should be exercised when interpreting the presence of animal waste.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».