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Enregistrement W4410570905 · doi:10.1111/nph.70192

<scp>B4</scp> Raf‐like <scp>MAPKKK RAF24</scp> regulates <i>Arabidopsis thaliana</i> flowering time through <scp>HISTONE MONO</scp> ‐ <scp>UBIQUITINATION</scp> 2

2025· article· en· W4410570905 sur OpenAlexafffund
Qiaomu Li, Le Wang, Lauren E. Grubb, Mohana Talasila, M. C. Rodriguez Gallo, Devang Mehta, Sabine Scandola, R. Glen Uhrig

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesUniversity of California, DavisUniversity of TorontoCanada Foundation for InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésArabidopsisBiologyPhosphorylationArabidopsis thalianaInteractomeUbiquitin ligasePhosphoproteomicsUbiquitinCell biologyProtein phosphorylationHistoneKinaseProtein kinase ABiochemistryGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The timing of flowering is a critical agronomic trait governed by an extensive and sophisticated regulatory network. To date, limited understanding of how posttranslational modifications regulate flowering time exists. Here, using Arabidopsis, we resolve a role for the B4 Raf-like MAPKKK protein kinase RAF24 in regulating flowering time. Loss of RAPIDLY ACCELERATED FIBROSARCOMA24 (RAF24) led to premature flowering time through altered expression of FLC and FT. Comparative phosphoproteomic analysis of raf24 and wild-type plants revealed a list of known flowering-related phosphoproteins from distinct flowering pathways displaying downregulated phosphorylation. Of these, the RING-type ubiquitin ligase HISTONE MONO-UBIQUITINATION 2 (HUB2) lacked phosphorylation in the absence of RAF24. Absence of RAF24 induced H2Bub1 overaccumulation, with protein-protein interactome analysis of HUB2 in the presence and absence of RAF24 influencing HUB2 protein interaction partners, such as H2B. HUB2 was also found to physically interact with SUCROSE NONFERMENTING KINASE 2.4 (SnRK2.4) and SnRK2.6, known substrates of RAF24. Using phospho-mimetic and phospho-ablative plant lines, we then validated the importance of HUB2 phosphorylation at serine 314 (S314) in maintaining appropriate flowering time. Our findings uncovered a novel biological role of RAF24, as a higher-order flowering regulator, while further implicating HUB2 as a centerpiece of flowering time regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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