Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in <i>TP53</i> -Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Myelodysplastic syndrome and acute myeloid leukemia with complex and monosomy karyotypes show a high prevalence of TP53 mutations (TP53m), poor response to induction chemotherapy, and adverse outcomes. These diseases may respond to decitabine, but the mechanisms are presently unclear. EXPERIMENTAL DESIGN: Patients with myelodysplastic syndrome and acute myeloid leukemia were treated with decitabine for 10 days in a phase II clinical study. In this study, we collected serial samples from patients before and at the completion of decitabine treatment, morphologic remission, and relapse. The samples were interrogated with targeted myeloid panel sequencing, nanopore DNA cytosine methylation sequencing, and single-cell transcriptomics to investigate potential interactions between leukemic and immune populations. RESULTS: The integrative analysis allowed for the characterization of shifting dynamics within leukemic and immune cell populations in individual patients. Single-cell transcriptomic analyses confirmed immune activation in TP53m responders after decitabine treatment. At relapse, leukemic populations showed upregulation of MYC signaling and heat shock response, whereas T cells showed an exhaustion signature. CONCLUSIONS: Our work highlighted the complex interplay between leukemic and immune populations in TP53m patients upon decitabine treatment that might account for clinical responses and subsequent relapses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».