Molecular basis for presentation of N-myristoylated peptides by the chicken YF1∗7.1 molecule
Notice bibliographique
Résumé
Major histocompatibility complex I (MHC-I) and MHC-I-like molecules play a central role in mediating immunity. Through their conservation across all taxa of jawed vertebrates, the MHC-I-like proteins have adapted to present non-peptidic antigens to distinct T cell populations. While our understanding of the structure-function relationship of MHC-I and MHC-I-like molecules in humans and mice is well established, the nature of the antigens presented by MHC-I- like molecules in "non-model" species remains unclear. Here, using a mammalian recombinant expression system combined with mass spectrometry approaches, we identified N-myristoylated peptides as endogenous ligands for the chicken MHC-I-like protein YF1∗7.1. Given the importance of N-myristoylation in viral pathogenesis, we determined the crystal structure of YF1∗7.1 in complex with two N-myristoylated peptides derived from Marek's disease virus (MDV), demonstrating the molecular basis that underpins the presentation of N-myristoylated peptides from MDV, a highly contagious and fatal viral neoplastic disease in chickens. Thus, the identified ligands are distinct from unmodified peptides found in classical MHC-I and -II as well as diverse amphipathic lipids captured by CD1 proteins. Collectively, our study lays the foundation for further molecular and functional characterization of YF1∗7.1 and more broadly of the role of the MHC-I encoded by the MHC-Y gene cluster in protection against highly contagious viral neoplastic diseases in chickens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».