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Enregistrement W4410608172 · doi:10.1101/2025.05.21.655318

FimX regulates type IV pilus localization via the Pil-Chp chemosensory system in <i>Acinetobacter baylyi</i>

2025· preprint· en· W4410608172 sur OpenAlexafffund
Ian Y. Yen, P. Lynne Howell, Courtney K. Ellisonss

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenDamon Runyon Cancer Research Foundation
Mots-clésPilusAcinetobacterMicrobiologyBiologyCell biologyChemistryBiochemistryEscherichia coliGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Type IV pili (T4P) are widespread dynamic appendages required for diverse prokaryotic behaviors including twitching motility, biofilm formation, and DNA uptake leading to natural transformation. Although the components involved in T4P assembly and dynamics are largely conserved across divergent clades of bacteria, the mechanisms underlying T4P function and regulation differ significantly and remain poorly characterized outside of a select few model organisms. One understudied characteristic of T4P includes the spatial organization of T4P envelope-spanning nanomachines and how organizational patterns contribute to single cell behaviors. The bacterial species Acinetobacter baylyi localizes its T4P nanomachines in a unique pattern along the long axis of the cell, making it a robust model to study the mechanisms underlying the regulation of intracellular organization in single cell organisms. In this work, we find that the T4P regulatory protein FimX has been co-opted away from regulating T4P dynamics to instead control T4P positioning through a chemosensory Pil-Chp pathway. We show FimX directly interacts with the Pil-Chp histidine kinase ChpA which likely influences Pil-Chp signaling and the subsequent positioning of T4P machines. These data contribute to our understanding of how bacterial regulatory systems can evolve to function in diverse biological processes. SIGNIFICANCE STATEMENT Subcellular organization of protein complexes plays a vital role in their function in all domains of life, yet the molecular mechanisms underlying subcellular organization in bacteria remain poorly understood. This work shows the T4P regulatory component FimX directly interacts with a chemosensory signaling protein to regulate the positioning of T4P nanomachines. These data provide insight into how signaling systems can evolve to regulate diverse processes, and they establish a direct connection between environmental signaling cascades and the regulation of bacterial cell biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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