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Enregistrement W4410613053 · doi:10.1016/j.indcrop.2025.121184

Metabolomic and transcriptomic analyses reveal positive roles of root border cells in salinity resistance in cotton (Gossypium hirsutum L.)

2025· article· en· W4410613053 sur OpenAlexaff
Jingxia Zhang, Ao Pan, Yu Chen, Shengli Wang, Zhangqiang Song, Yang Gao, Juan Zhou, Zhaohai Du, Xuehan Huo, Furong Wang

Notice bibliographique

RevueIndustrial Crops and Products · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueResearch in Cotton Cultivation
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Shandong ProvinceKey Technology Research and Development Program of ShandongChina Agricultural Research SystemNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGossypium hirsutumMetabolomicsGossypiumTranscriptomeBiologyResistance (ecology)SalinityBotanyGeneGeneticsAgronomyBioinformaticsGene expressionEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Root border cells (RBCs) play important roles in plant stress tolerance. However, their roles and underlying mechanisms in salinity stress responses remain largely unknown. To elucidate the salinity-induced metabolic adaptations and transcriptional responses of RBCs in cotton ( Gossypium hirsutum L.), we performed a comparative analysis of the metabolomes and transcriptomes of RBCs and adjacent naked root tips (NRTs, RBCs removed) under salinity stress. A total of 150 and 195 differentially accumulated metabolites, along with 10,593 and 7270 differentially expressed genes (DEGs) were identified in RBCs and NRTs, respectively. RBCs exhibited elevated accumulation of glycerophospholipids, sterols, unsaturated fatty acids and betaine relative to NRTs, which are crucial for maintaining membrane stability and osmoregulation. Enrichment analysis revealed that the α-linolenic acid metabolism pathway, participating in both lipid metabolism and jasmonic acid (JA) biosynthesis, was specially enriched in RBCs. DEGs associated with JA and salicylic acid signaling pathways showed markedly higher upregulation in RBCs than in NRTs, indicating stronger stress-responsive signaling in RBCs under salinity stress. Notably, azelaic acid (AZA), a lipid signaling molecule, was accumulated at higher levels in RBCs. Exogenous AZA application increased the production of RBCs and improved cotton seedling salinity tolerance. Taken together, higher accumulation of membrane-stabilizing and signaling lipids, as well as stronger JA/SA signal transduction promote salinity tolerance in RBCs. These findings expand our understanding of plant metabolic alterations in response to salinity stress and offer potential targets for improving cotton salinity tolerance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,507
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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