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Enregistrement W4410614424 · doi:10.1093/plcell/koaf126

Phosphoglycerate dehydrogenase is required for kernel development and defines a predominant serine synthesis pathway in maize

2025· article· en· W4410614424 sur OpenAlexaff
Ying Zhang, Ruiyuan Li, Danyang Zheng, Jinhong Zhao, Ke Qing, Zhaoxing Ma, Nianguo Xue, Xing Tian, E. C. Wang, Jiameng Xu, Yubin Li, Bao‐Cai Tan, Zhipeng Zhou, Chengyuan Wang, Jiaqiang Dong

Notice bibliographique

RevueThe Plant Cell · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesUniversity of Science and Technology of ChinaChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing Academy of Agricultural and Forestry SciencesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNatural Science Foundation of Shandong ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaQingdao Agricultural University
Mots-clésBiologySerineBiochemistryBiosynthesisProtein biosynthesisPhosphoserinePhosphorylationCell biologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Serine functions as both a substrate for protein biosynthesis and a signaling molecule for growth and development. However, the mechanism remains poorly understood. Here, we cloned and functionally characterized the maize (Zea mays) gene Dek20, which encodes phosphoglycerate dehydrogenase1 (PGDH1), the rate-limiting enzyme in the phosphorylated pathway of serine biosynthesis (PPSB). The dek20(Ser282Leu) mutation disrupts the interaction between residues Ser282 and His284, leading to the release of His284, which subsequently binds NAD+/NADH to inhibit serine biosynthesis. Consequently, serine content decreases dramatically, and the cellular response to nutrient starvation is enriched in transcriptome analysis. Serine deficiency triggers tRNASer degradation and reduced translation elongation at serine codons. The stalled ribosomes activate General Control Nonderepressible 2 (GCN2) kinase, which affects the phosphorylation of eukaryotic initiation factor 2α (eIF2α) and ribosomal protein S6 kinase (S6 K), furtherly inhibiting translation initiation. Consistent with these findings, polysome profiling and Ribo-seq analysis revealed a marked decrease in translation efficiency in dek20. Notably, proteins essential for storage compound biosynthesis and cell cycle progression exhibit reduced translation in dek20. Collectively, our findings reveal the primary serine biosynthesis pathway and a mechanism for monitoring amino acid levels in maize, the model plant with C4 photosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,281

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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