Nucleation of biomimetic hydroxyapatite nanoparticles on the surface of human type I collagen using a hybrid all-atom and coarse-grained model
Notice bibliographique
Résumé
Inorganic mineral/collagen composite materials are one of the most attractive implant materials for bone repair engineering. Mineralized collagen composites have a similar hierarchical structure and biological activity to natural bone; however, the mechanism of the mineralization process is complex, and the properties of mineralized materials are difficult to control during the preparation process. Currently, this is a significant challenge in coarse-grained organic-inorganic systems. Thus, a coarse-grained/all-atom multiscale model was employed to investigate the biomineralization process. Based on the free energy of the all-atom ion association, we obtained the coupling parameters of the multiscale model, which were similar to those of the all-atom model. In this multiscale simulation model, coarse-grained models were used for type I collagen protein and water molecules and all-atom models for phosphate and calcium ions. The coarse-grained/all-atom multiscale model of mineralized collagen identified the same nucleation site and calcium phosphate aggregation process as the all-atom model. Additionally, the calcium phosphate clusters still retained site-selectivity around the coarse-grained collagen surface during the nucleation process. At the same time, the clusters tended to have a certain crystal structure morphology during the long-time simulation. This new strategy will help accelerate biomaterial design and optimization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».