Nucleation of biomimetic hydroxyapatite nanoparticles on the surface of human type I collagen using a hybrid all-atom and coarse-grained model
Notice bibliographique
Résumé
Inorganic mineral/collagen composite materials are one of the most attractive implant materials for bone repair engineering. Mineralized collagen composites have a similar hierarchical structure and biological activity to natural bone; however, the mechanism of the mineralization process is complex, and the properties of mineralized materials are difficult to control during the preparation process. Currently, this is a significant challenge in coarse-grained organic-inorganic systems. Thus, a coarse-grained/all-atom multiscale model was employed to investigate the biomineralization process. Based on the free energy of the all-atom ion association, we obtained the coupling parameters of the multiscale model, which were similar to those of the all-atom model. In this multiscale simulation model, coarse-grained models were used for type I collagen protein and water molecules and all-atom models for phosphate and calcium ions. The coarse-grained/all-atom multiscale model of mineralized collagen identified the same nucleation site and calcium phosphate aggregation process as the all-atom model. Additionally, the calcium phosphate clusters still retained site-selectivity around the coarse-grained collagen surface during the nucleation process. At the same time, the clusters tended to have a certain crystal structure morphology during the long-time simulation. This new strategy will help accelerate biomaterial design and optimization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».