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Enregistrement W4410640761 · doi:10.1021/jasms.5c00113

Increased Throughput of Combined Stability Testing and Metabolite Identification Using a Sample Multiplexing Strategy for the Optimization of Engineered Cyclic Peptide Drugs

2025· article· en· W4410640761 sur OpenAlexaff
Congliang Sun, Mark T. Cancilla, Bahanu Habulihaz, Lisa A. Vasicek, Daniel S. Spellman, Sven Hackbusch, Sébastien Morin

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society for Mass Spectrometry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensThermo Fisher Scientific (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryMetaboliteThroughputPeptideMultiplexingHigh-throughput screeningChromatographyIdentification (biology)Computational biologyCombinatorial chemistryBiochemistryComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Engineered cyclic peptides (ECPs) have been in the spotlight as novel drug modalities for challenging therapeutic targets. Oral delivery of engineered cyclic peptides benefits from ease of administration. However, one of the main hurdles in developing orally effective peptide drugs is their potential metabolic instability due to enzymatic degradation. To that end, in vitro experiments with simulated intestinal fluid (SIF) have been used to assess drug metabolic stability in the gastrointestinal tract. Currently, metabolic stability evaluations and biotransformation assessments are performed separately, which can be time-consuming and result in complex data analysis. Presented here is a sample multiplexing strategy to address these challenges by leveraging a Thermo Scientific Orbitrap Astral mass spectrometer with two complementary analyzers, enabling the simultaneous analysis of metabolic stability from the Orbitrap full scan and biotransformation from the Astral analyzer from one sample injection. Furthermore, we demonstrate that 10 engineered cyclic peptides can be pooled into one sample injection without compromising the data quality to decrease the instrument run time and improve the throughput of the assay.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,183
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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