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Enregistrement W4410649473 · doi:10.1101/2025.05.20.655035

The <i>JAW-TCP-FUL</i> genetic axis triggers an early reorientation of cell anisotropy to initiate and drive fertilization-dependent fruit elongation in Arabidopsis

2025· preprint· en· W4410649473 sur OpenAlexfundno aff
Anurag N. Sharma, G Kirti, V Avani, Nikhil Shanmugham S. S., Ahana Jayanarayan Perumadaraya, Mariam Khadeeja, Dhanya Pradeep, Sharath Basavaraju, Kailash Chandra, Annapoorni Rangarajan, Utpal Nath

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversità degli Studi di MilanoDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaShimane UniversityDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaUniversité de MontréalCouncil of Scientific and Industrial Research, IndiaNational Research FoundationUniversity of California, San DiegoIndian Institute of Science
Mots-clésElongationArabidopsisHuman fertilizationAnisotropyCell biologyMaterials scienceBiologyAgronomyPhysicsComposite materialGeneticsGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In angiosperms, the ovary grows and develops into a fruit after fertilization, and the seeds are formed within to ensure reproductive success. Although genetic regulators suppressing fertilization-independent fruit growth or parthenocarpy have been identified in the Brassicaceae model Arabidopsis thaliana , the fertilization-dependent activator of fruit growth has not been elucidated. Here, we show that the miR319-regulated TCP transcription factors (JAW-TCPs) directly activate the transcription of the FRUITFULL ( FUL ) gene and promote fruit morphogenesis. By activating FUL , JAW-TCPs indirectly repress the four valve-margin specifying genes SHATTERPROOF1 , SHATTERPROOF2 , INDEHISCENT and ALCATRAZ in the valves. Mutating these genes suppresses defects caused by the combined loss of JAW-TCPs and FUL . Through extensive confocal imaging studies, we deciphered the cellular basis of JAW-TCP function revealing that JAW-TCPs promote fruit elongation by triggering the reorientation of cell anisotropy along the length axis at an early growth stage after fertilization. Our study uncovers a fertilization-dependent genetic module driving fruit elongation and sets the stage to identify other genetic regulators in this pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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