Continued collaboration of ex situ and in situ programs is critical for the genetic sustainability of the endangered Rana pretiosa
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Retaining sufficient genetic variation for both short and long-term sustainability is a chief aim of ex situ programs for threatened species. Conservation breeding and reintroduction programs exist but oftentimes little is known about the genetic variation of in situ or ex situ populations. We collected genetic samples from both wild and zoo populations of Canada’s most endangered anuran, the Oregon Spotted Frog (Rana pretiosa) to compare genetic diversity (observed and expected heterozygosity), inbreeding coefficients (FIS), effective population sizes (Ne) and population structure using single-nucleotide polymorphisms (SNPs). We found low diversity in situ and lower diversity ex situ, with positive inbreeding coefficients indicating assortative mating in both wild and zoo populations. Ex situ breeding programs that allowed free mate choice retained more genetic variation compared to those where breeding groups were pre-determined. Mixed source zoo populations were less differentiated from their wild source populations than the latter were among themselves, indicating sufficient representation of wild populations in zoo populations. The patterns we uncover support continued collaboration of ex situ and in situ endeavours as supplementation will likely be required for the long-term viability of the very wild populations the zoos rely on for genetic sustainability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».