NONINVASIVE URINARY PROTEOMICS PROVIDES VALUABLE INSIGHT INTO THE MOLECULAR CHARACTERISTICS FOR LUPUS NEPHRITIS
Notice bibliographique
Résumé
O057 / #226 Topic:AS15 - Lupus Nephritis-Clinical ABSTRACT CONCURRENT SESSION 10: INTEGRATING PROTEOMIC & TRANSCRIPTOMICS IN SLE 24-05-2025 10:40 AM - 11:40 AM Background/Purpose Lupus nephritis (LN) is a common complication of systemic lupus erythematosus that presents a high risk of end-stage renal disease. Clinically, the therapy of lupus nephritis mainly depends on the renal pathological LN classification by renal biopsy. However, the renal biopsy could not repeated as much as clinically request for invasiveness and the renal outcomes are still unsatisfactory. Thus, noninvasive tools stratifying LN patients are urgently needed. Methods Here, we collected 112 urine samples from LN patients on the day before they received renal biopsy and performed in-depth urine proteomics test. Associations between urinary proteomic analysis with clinical features, pathological data, and laboratory findings were further investigated. Results Unsupervised clustering distinguished 4 molecular subtypes (type1-4). Type 1 was marked with high expression of immunomodulatory proteins and associated with renal pathological findings of higher LN pathological acute index (AI) including more cellular/cytofibrous crescent and increased leukocyte infiltration in glomeruli. Clinically, patients with type 1 showed a higher proportion of renal response rate (83%) to prednisone combined with mycophenolate mofetil. In patients with type 2, keratins were significantly upregulated, indicating their role in cell structure maintaining. Type 3 displayed the overactivation of complement system with higher expression of complement from 3 to 9 and regulatory protein of factor B and D, which might suggest potential therapeutic of complement inhibitors like eculizumab or iptocapan. Clinically, patients with type 3 showed more acute and chronic renal function injury. Type 4 was characterized by metabolic abnormalities and overexpression of SLC5A1 emerged as a distinctive hallmark. The patients with type 4 had higher rate of proteinuria and lower treatment response rate to standard therapy (55%) with stable renal function. Conclusions Noninvasive urinary proteomics provides valuable insight into the molecular characteristics and suggest new biomarkers of precise treatment in lupus nephritis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».