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Enregistrement W4410729802 · doi:10.1101/2025.05.21.655284

Unravelling the constrained cell growth in engineered living materials

2025· preprint· en· W4410729802 sur OpenAlexaff
S. F. Sun, Cheng-Cheng Ding, Hou–Yong Yu, Xian-Zheng Yuan, Shuguang Wang, Peng‐Fei Xia

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensDepartment of Environment and Conservation
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaDepartment of Science and Technology of Shandong ProvinceShandong University
Mots-clésBiochemical engineeringEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Engineered living materials (ELMs) leverage the integrative advantages of materials science and synthetic biology for advanced functionalities. Predicting and controlling cellular behavior is essential for designing and building ELMs, requiring fundamental understanding of the growth dynamics of encapsulated cells. Here, we interrogate the interference of constrained growth on the engineered functionalities and cellular physiology of cyanobacteria and unveil the dynamic interaction between cell growth and spatial confinements within photosynthetic ELMs. We observed that engineered cyanobacteria within ELMs exhibited compromised performances in growth, uptake of non-natural substrate, and synthesis of customized products, while ELMs could protect encapsulated cells from external stresses. Besides commonly accepted external influences, we identified abnormally high levels of reactive oxygen species and impaired oxygenic photosynthesis inside the cells encapsulated in ELMs. Finally, we illustrated the dynamics of cell growth within the confined spaces enveloped by the material matrices, forming clustered cell aggregates and compressed growth bubbles until the spatial limits. Our study provides a fundamental yet often overlooked connection between cellular behavior and spatial confinements, consolidating the foundation for advanced ELM innovations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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