MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410738474 · doi:10.1101/2025.05.23.655837

Eukaryotic recombinases duplicated after divergence from known asgardarchaeal RadA: implications for the evolution of sex during eukaryogenesis

2025· preprint· en· W4410738474 sur OpenAlexafffund
Lisa Matsuo, Anna M. G. Novák Vanclová, Andrew Pomiankowski, Nick Lane, Joel B. Dacks

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilBill and Melinda Gates FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésRecombinaseDivergence (linguistics)Evolutionary biologyBiologyGeneticsRecombinationPhilosophyLinguisticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The origin of meiotic sex was a key milestone in the evolution of the eukaryotic cell. The DNA recombinases Rad51 and DMC1 have been used previously to trace the timing and origins of the meiotic machinery, and warrant revisiting in the face of the recent increased diversity of reported asgardarchaeal taxa. Here we perform comparative genomics and phylogenetic analyses of RadA protein sequences from a broad sampling of eukaryotic and archaeal taxa. We show that even with increased and new sampling, the eukaryotic Rad51 and DMC1 proteins still resolve separately from any archaeal RadA sequences. Taking into account recent evolutionary cell biological discoveries, our data are most consistent with a scenario whereby the asgardarchaeal host cell was evolving cytoskeletal and membrane-protein machinery that was later incorporated into eukaryotic endomembrane systems following the acquisition of mitochondria and the evolution of sex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetProtist diversity and phylogenyTravaux en français237 207