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Enregistrement W4410746662 · doi:10.1111/2041-210x.70037

Deep learning meets tree phenology modelling: <scp>PhenoFormer</scp> versus process‐based models

2025· article· en· W4410746662 sur OpenAlexaff
Vivien Sainte Fare Garnot, Lynsay Spafford, J. Jelle Lever, Christian Sigg, Barbara Pietragalla, Yann Vitasse, Arthur Geßler, Jan Dirk Wegner

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueRemote Sensing in Agriculture
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenologyTree (set theory)Process (computing)Computer scienceEcologyBiologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Predicting phenology, that is the timing of seasonal events of plant life such as leaf emergence and colouration in relation to climate fluctuations, is essential for anticipating future changes in carbon sequestration and tree vitality in temperate forest ecosystems. Existing approaches typically rely on either hypothesis‐driven process models or data‐driven statistical methods. Several studies have shown that process models outperform statistical methods when predicting under climatic conditions that differ from those of the training data, such as for climate change scenarios. However, in terms of statistical methods, deep learning approaches remain underexplored for species‐level phenology modelling. We present a deep neural architecture, PhenoFormer, for species‐level phenology prediction using meteorological time series. Our experiments utilise a country‐scale data set comprising 70 years of climate data and approximately 70,000 phenological observations of nine woody plant species, focussing on leaf emergence and colouration in Switzerland. We extensively compare PhenoFormer to 18 different process‐based models and traditional machine learning methods, including Random Forest (RF) and Gradient Boosted Machine (GBM). Our results demonstrate that PhenoFormer outperforms traditional statistical methods in phenology prediction while achieving significant improvements or comparable performance to the best process‐based models. When predicting under climatic conditions similar to the training data, our model improved over the best process‐based models by 6% normalised root‐mean‐squared error (nRMSE) for spring phenology and 7% nRMSE for autumn phenology. Under conditions involving substantial climatic shifts between training and testing (+1.21°C), PhenoFormer reduced the nRMSE by an average of 8% across species compared to RF and GBM, and performed on par with the best process models. These findings highlight the potential of deep learning for phenology modelling and call for further research in this direction, particularly for future climate projections. Meanwhile, the advancements achieved by PhenoFormer can provide valuable insights for anticipating species‐specific phenological responses to climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,380
Score d'incertitude au seuil0,666

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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