<i>Petrotoga</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Pe.tro.to.ga. Gr. fem. n. petra, rock, stone; L. fem. n. toga, Roman outer garment; N.L. fem. n. Petrotoga , the stone outer garment. The genus Petrotoga comprises sheathed, anaerobic, fermentative, and hydrogen‐producing bacteria. Petrotoga are thermophilic and slightly halophilic. Growth is supported by a broad range of carbohydrates in the presence of yeast extract. Elemental sulfur is reduced by all strains. Petrotoga spp. are members of the phylum Thermotogota , class Thermotogae, order Petrotogales , and family Petrotogaceae . The genus Petrotoga includes six species with validly published names: P. halophila , P. mexicana , P. miotherma , P. mobilis , P. olearia , and P. sibirica . The seventh species, “ P. japonica ,” has not been validly published yet. Genome sizes of the validly published species range from 2.03 to 2.82 Mb, and their GC content varies between 33.8 and 34.1%. Motility has been observed for P. mobilis, P. olearia, P. sibirica, P. mexicana, and “P. japonica,” but not for P. miotherma and P. halophila . Known habitats are oil reservoirs and wastewater environments. DNA G + C content (mol%) : 33.8–34.1 (genome analysis for the 6 species with validly published names); 32.4 (HPLC for “ P. japonica ”). Type species : Petrotoga miotherma Davey et al. 1993, VL47. Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Petrotoga is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Thermotogati / Thermotogota / Thermotogae / Petrotogales / Petrotogaceae / Petrotoga The genus Petrotoga can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Petrotoga (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Thermotogota / c__Thermotogae / o__Petrotogales / f__Petrotogaceae / g__Petrotoga * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ) Nucleic Acids Res , 50 , D785 –
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,464 | 0,359 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».