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Enregistrement W4410772318 · doi:10.1073/pnas.2423831122

Mgat4b-mediated selective <i>N</i> -glycosylation regulates melanocyte development and melanoma progression

2025· article· en· W4410772318 sur OpenAlexfundno aff
Babita Sharma, Keerthic Aswin, Tanya Jain, Ayesha Nasreen, Ayush Aggarwal, Yogaspoorthi Subramaniam, Jeyashri Rengaraju, Srashti Jyoti Agrawal, Madan Lal Brahma Bhatt, Bhashkar Paul, Aanchal Yadav, Jyoti Soni, Rajat Ujjainiya, Md Quasid Akhter, Rajesh Pandey, Shruthy Suresh, Srinivasa‐Gopalan Sampathkumar, Vivek T. Natarajan

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesScience and Engineering Research BoardCouncil of Scientific and Industrial Research, IndiaCanada Millennium Scholarship FoundationIndian Institute of Science
Mots-clésMelanocyteMelanomaBiologyZebrafishMicrophthalmia-associated transcription factorCell biologyCancer researchCell migrationCell adhesionCellGeneticsTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Melanocyte development involves key pathways that are often recapitulated during melanoma initiation, highlighting the importance of understanding these regulatory processes. Our study identifies mgat4b , a glycosyl transferase involved in selective N -glycan branching enriched in pigment progenitors, as a regulator of directional cell migration and establishment of melanocyte stem cell (McSC) pool during early development. Single cell RNA (scRNA) sequencing analysis in zebrafish upon targeted disruption of mgat4b reveals, that migratory melanocyte progenitors marked by galectin expression fail to persist. Lectin affinity proteomic analysis reveals the glycosylation of key melanocyte proteins GPNMB, KIT, and TYRP1 to be under the control of MGAT4B in melanocytic cells. Additionally, mislocalization of Junctional plakoglobin (JUP) explains the observed defects in cell adhesion and migration to be regulated by MGAT4B but not its isozyme MGAT4A. Our meta-analysis further reveals that melanoma patients with both the BRAF V600E mutation and elevated MGAT4B levels have significantly worse survival outcomes compared to those with only the BRAF V600E mutation. By leveraging the zebrafish MAZERATI platform to model BRAF V600E driver mutation in vivo, we show that mgat4b mutant cells fail to aggregate and initiate tumors. RNA profiling of the transformed melanocytes revealed cell–cell junction, adhesion, and ECM binding to be probable contributing factors that resulted in the failure of tumor onset. Using a small-molecule inhibitor we demonstrate that complex N -glycosylation inhibits early-stage melanoma progression. Our study underscores the importance of selective N -glycan branching in both melanocyte development and melanoma initiation, suggesting MGAT4B as a promising therapeutic target for melanoma treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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