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Enregistrement W4410784829 · doi:10.3389/fevo.2025.1604480

WEGAN: a web-based community ecology platform

2025· article· en· W4410784829 sur OpenAlexafffund
Gina Sykes, Louisa Normington, Jenna Poelzer, Shiyang Zhao, Dana Allen, Samuel Stuart, Eponine Oler, Komal Jot, Vasuk Gautam, Zhao Xin, Jianguo Xia, Glen C. Jickling, David S. Wishart

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Ecology and Evolution · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueGeographic Information Systems Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Northern British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMultiple Sclerosis International FederationGenome Canada
Mots-clésEcologyCommunityWorld Wide WebGeographyEnvironmental resource managementEnvironmental scienceBiologyComputer scienceEcosystem

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Community ecology studies how species interact in their ecosystems, influenced by environmental and phenotypic factors. Analyzing these complex interactions requires specialized software or proficiency in statistical programming. While many stand-alone community ecology software tools exist, there is a gap for a free and widely available webserver to support community ecology analysis. To address this shortcoming we have developed WEGAN (Web-based Ecological Group Analysis), an easy-to-use webserver for analyzing and visualizing community ecology data. WEGAN is designed to provide features offered by popular programs such as vegan through a point-and-click web interface. Specifically, WEGAN provides a wide range of community ecology methods to support the analysis and visualization of trends in dispersal, diversity, and taxonomy as well as univariate and multivariate statistics for clustering, classification, correlation, and ordination analysis. WEGAN offers intuitive workflows and generates detailed tables, publication quality figures and a complete (reproducible) R coding history of all inputs, operations and outputs for every user session, together with comprehensive tutorials. WEGAN was developed to help with the teaching and training of community ecology and to encourage wider use of sophisticated community ecology techniques. WEGAN is freely available at https://www.wegan.ca .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,188

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,006
Science ouverte0,0040,006
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0560,034

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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