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Enregistrement W4410788532 · doi:10.1186/s13567-025-01538-4

Post-outbreak dynamics and persistence of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 15 in finisher pigs in Iowa

2025· article· en· W4410788532 sur OpenAlexaff
Marcelo Nunes de Almeida, Pablo Piñeyro, Derald Holtkamp, Isadora Machado, Ana P. S. Silva, Guilherme Cezar, P. John Thomas, Marcelo Gottschalk, Alyona Michael

Notice bibliographique

RevueVeterinary Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOutbreakSerotypePersistence (discontinuity)Veterinary medicineBiologyActinobacillus pleuropneumoniaeEpidemiologyActinobacillusAnimal scienceVirologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 2021, Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 15 (App15) mediated a high mortality respiratory outbreak in finisher hogs, affecting multiple companies within a 30-km radius of Iowa, USA. The atypical regional spread raised concerns for the strain's unusual environmental persistence and survivability. This prospective longitudinal study aimed to determine the duration of App15 persistence in convalescent pigs at a naturally infected 1200 head site. Sixty-seven pigs were sampled individually for 6 weeks using nasal swabs (NS), tonsil scrapings (TS), and serum samples (SS); pen-based oral fluids (OF) were also collected. NS, TS, and OF were tested for App by rtPCR, while serum was screened with the Swinecheck mix-App ELISA. All 67 pigs tested App PCR positive in TS ≥ 1 during the sampling period, with progressive increases in detection from 53.3% to 95.8% between the first and last sampling week, respectively. Only 23 pigs (34.3%) were PCR positive by NS ≥ 1 during the sampling period, with decaying detection rates from a peak of 51.2% positivity in the first sampling week. Fifty-three of 73 pens (72.6%) tested App PCR positive in OF ≥ 1 during the sampling period. Seropositivity decreased from 93% on week 4- to 33% on week 8. TS had the highest PCR detection rate at all time points evaluated, representing the best antemortem sample type for App PCR detection in this study. The results reported here generated new important knowledge related to App15 ecology and epidemiology, prospectively informing disease diagnosis, surveillance, and biosecurity practices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,885
Score d'incertitude au seuil0,478

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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