Post-outbreak dynamics and persistence of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 15 in finisher pigs in Iowa
Notice bibliographique
Résumé
In 2021, Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 15 (App15) mediated a high mortality respiratory outbreak in finisher hogs, affecting multiple companies within a 30-km radius of Iowa, USA. The atypical regional spread raised concerns for the strain's unusual environmental persistence and survivability. This prospective longitudinal study aimed to determine the duration of App15 persistence in convalescent pigs at a naturally infected 1200 head site. Sixty-seven pigs were sampled individually for 6 weeks using nasal swabs (NS), tonsil scrapings (TS), and serum samples (SS); pen-based oral fluids (OF) were also collected. NS, TS, and OF were tested for App by rtPCR, while serum was screened with the Swinecheck mix-App ELISA. All 67 pigs tested App PCR positive in TS ≥ 1 during the sampling period, with progressive increases in detection from 53.3% to 95.8% between the first and last sampling week, respectively. Only 23 pigs (34.3%) were PCR positive by NS ≥ 1 during the sampling period, with decaying detection rates from a peak of 51.2% positivity in the first sampling week. Fifty-three of 73 pens (72.6%) tested App PCR positive in OF ≥ 1 during the sampling period. Seropositivity decreased from 93% on week 4- to 33% on week 8. TS had the highest PCR detection rate at all time points evaluated, representing the best antemortem sample type for App PCR detection in this study. The results reported here generated new important knowledge related to App15 ecology and epidemiology, prospectively informing disease diagnosis, surveillance, and biosecurity practices.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».