Association of intestinal exfoliome and Prevotellaceae with toxicity and clinical outcome during immune-checkpoint blockade.
Notice bibliographique
Résumé
2664 Background: Immune-related adverse events (irAEs) are autoimmune side effects related to ICI, varying in severity, onset and organ involvement that may be hard to differentiate from non-irAEs. Some reports have demonstrated that gut microbiota (GM) plays a role in modulating the risk of AEs. In this study, we combine gut mamalian and microbial metagenomics sequencing (MGS) to explore the influence of GM on treatment response and risk of AEs. Methods: NCT04567446 allowed fecal MGS at baseline and longitudinally in patients (pts) with advanced non-small cell lung cancer (), renal cell carcinoma and bladder cancer treated with ICI alone (ICI cohort, n = 542pts) or in combination with chemotherapy (CT+ICI cohort, n = 122 pts) in France and Canada. Pts who experienced severe (≥ grade 3) irAEs after ICI+/-CT were compared to those who did not, using microbial MGS parameters (Shannon diversity, TOPOSCORE, PCoA and LEfSe). Multivariate Cox regression models to analyze factors influencing overall survival (OS) included microbiota composition and the host exfoliome (i.e., mammalian eukaryotic DNA read counts within stools). Results: Pts with severe irAEs (10%) presented a less diverse microbiome, a lower TOPOSCORE and a distinct microbial community compared to those without severe irAEs, showing an overabundance of several members of the Prevotellaceae family. Interestingly, CT+ICI pts who experienced severe irAEs had the most dysbiotic microbiome, characterized by a lower alpha-diversity and TOPOSCORE, dominated by oral taxa ( Ligilactobacillus salivarius) and tolerogenic Hungatella spp. and Enterocloster spp. Among pts screened for exfoliation, 44% presented hstool mammalian DNA than healthy subjects, showed a GM enriched with pathobionts, including the Enterocloster genus, and exhibited worse OS (HR 1.212, p = 0.0135) in univariate and multivariate analyses (HR 1.18, p = 0.049). Although there was no significant correlation between toxicity and exfoliation, either in CT+ICI or ICI alone, pts enriched with Prevotellaceae family appeared to exhibit the highest levels of exfoliation. Conclusions: Host-microbial interactions influence immunity and therefore ICI prognosis and toxicity. We found Prevotellaceae members as potential biomarkers for ICI-related toxicity. The host exfoliome is an interesting parameter that may reflect gut fitness, requiring further investigation. Clinical trial information: NCT04567446 .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».