MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410814946 · doi:10.1016/j.idcr.2025.e02274

Whole-genome sequencing confirms Shigella flexneri infection in a child with shock and suspected multisystem inflammatory syndrome in children: A case report

2025· article· en· W4410814946 sur OpenAlex
Sheridan J.C. Baker, Laura K. Erdman, Donald Brody Duncan, Tania Cellucci, Candy Rutherford, Marek Smieja, Cheryl Main, Jeffrey M. Pernica, Andrew G. McArthur

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueIDCases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensHamilton Health SciencesHamilton Regional Laboratory Medicine ProgramMcMaster Children's HospitalMcMaster University
Organismes subventionnairesMitacs
Mots-clésShigella flexneriMedicineShigellaWhole genome sequencingShock (circulatory)GenomeMicrobiologyVirologyGeneticsGeneInternal medicineEscherichia coliBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Differentiating severe systemic inflammatory syndromes from sepsis can be challenging. The diagnostic process may be further complicated by concurrent infection and hyperinflammation, with important management implications. We report a child with suspected multisystem inflammatory syndrome in children, who was unexpectedly diagnosed with Shigella gastroenteritis. Case presentation A previously healthy 6-year-old boy acutely presented with fever, vomiting, diarrhea, fluid-refractory shock, cardiac dysfunction, biochemical inflammation, and coagulopathy. He fulfilled diagnostic criteria for multisystem inflammatory syndrome in children, including SARS-CoV-2 exposure 8 weeks prior. He received both antibiotics and pulsed intravenous methylprednisolone, with rapid improvement. Stool molecular testing using a lab-developed multiplex qPCR assay revealed Shigella flexneri infection, confirmed by culture, MALDI-TOF mass spectrometry, and whole-genome sequencing. Serologic testing confirmed prior infection by the SARS-CoV-2 virus. The child fully recovered. Immunological investigations were normal. The case was investigated by the Public Health Department, but the source of Shigella infection was not identified. Conclusions This case underscores the importance of systematic microbiological workup in suspected systemic inflammatory syndromes, to identify infections that are treatable and of public health relevance. Given the rarity of Shigella septic shock in immunocompetent individuals, this case raises the possibility that recent SARS-CoV-2 infection led to immune dysregulation and exaggerated inflammatory responses to Shigella . It also demonstrates the utility of molecular testing for rapid diagnosis and confirmation of gastrointestinal infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,746

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle