Association of plasma biomarkers with recurrence in glioblastoma.
Notice bibliographique
Résumé
e14017 Background: Adult-type diffuse gliomas are common malignant tumors known for their high recurrence rates, regardless of grade. High recurrence is due to incomplete resection of the tumors and the infiltrative nature of the tumor cells. Unfortunately, prediction of recurrence relies solely on MRI, a method that is expensive and susceptible to errors, treatment and pseudo-progression effects. Capturing recurrence prior to MRI is an unmet clinical need and could allow for earlier intervention or enrolment of patients into clinical trials. Liquid biopsy has emerged as a promising approach. Methods: Previously collected patient plasma was retrieved from three sites: Northwestern University Tumor Biobank, Penn State Neuroscience Biorepository and University Health Network Biobank (Cross-sectional samples(all primary vs all recurrent) n = 264, patients with multiple samples (longitudinal) n = 44; Groups = Glioblastoma (GBM), astrocytoma, oligodendroglioma) and analyzed retrospectively for seven proteomic markers: GFAP, NEFL, FABP4, MMP1, MMP3, MMP9 and total tau (tTau) using research-use-only electrochemiluminescence assays available from Meso Scale Discovery. For the cross-sectional analysis (independent samples per patient), Wilcoxon rank sum test with post hoc Holm’s correction was used to compare biomarker values in samples from individuals with primary and recurrent tumors, after adjusting for sex differences. For the longitudinal analysis of paired primary and recurrence samples, Wilcoxon signed-rank test was used. Survival probability was tested through Kaplan-Meier survival curves. Results: In the cross-sectional analysis of the diffuse gliomas (GBM = 77+129 [Batch 1 + Batch 2], Oligodendroglioma = 23 +11, Astrocytoma = 26 + 25), we found that in the GBM group, the median values of MMP9 and GFAP were lower during recurrence. The median NEFL value was higher during GBM recurrence but did not achieve statistical significance, although the same effect was observed in the longitudinal analysis. In survival analyses, higher MMP3 and MMP9 in primary case samples across all diffuse gliomas were significantly associated with poorer survival, but this significance was lost during recurrence, indicating potentially important differences between a primary and a recurrent state. Conclusions: This cross-sectional and longitudinal retrospective pilot study evaluated seven plasma markers for the potential capability of predicting tumor recurrence in adult-type diffuse gliomas. While we found no significant differences across diffuse gliomas overall, subgroup analyses revealed recurrence-associated patterns. These findings suggest that certain markers could complement imaging for recurrence detection and perhaps prediction. Larger and more comprehensive studies are warranted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».