Genomic risk stratification in breast cancer: A 10-year follow-up of a single-institution prospective cohort comparing Oncotype DX and MammaPrint.
Notice bibliographique
Résumé
e13083 Background: This study investigates the concordance between the 21-gene recurrence score assay, Oncotype DX (ODX), and the 70-gene signature MammaPrint (MP) in a single academic center and evaluates their correlation with breast cancer outcomes. We previously reported a discordance between MP and ODX results; here, we present a 10-year follow-up survival data. Methods: This prospective cohort study included eighty-six consecutive patients between 2012-2014 with node-negative, hormone receptor-positive breast cancer whose tumor samples were tested using ODX. Based on ODX recurrence scores (RS), patients were treated with either a chemotherapy plus hormonal therapy group or a hormonal therapy-alone group. All patients were per standard practices at our institution. MP was subsequently performed on all samples, classifying patients as either low-risk (MP-L) or high-risk (MP-H). ODX risk classification was defined as intermediate/high risk (ODX-H) for RS ≥ 26 in postmenopausal and ≥ 16 in premenopausal patients (As defined by the TAILORx trial, the addition of chemotherapy to endocrine therapy resulted in an absolute risk reduction of 1.6% in distant recurrence-free survival), and otherwise low risk (ODX-L) (ODX ≤ 26 in postmenopausal or ≤ 15 in premenopausal). Results: In the overall population, the 10-year overall survival (OS), disease recurrence-free survival (DRFS), and breast cancer-free interval (BCFI) were 93%, 91%, and 86%, respectively. Patients classified as ODX-H had lower survival rates (OS: 88%, DRFS: 86%, BCFI: 84%) compared to MP-H patients (OS: 92%, DRFS: 89%, BCFI: 87%). Patients classified as ODX-L had numerically better outcomes than MP-L patients (OS: 100%, DRFS: 97%, BCFI: 89%) compared to (OS: 94%, DRFS: 92%, BCFI: 86%). Approximately 29% of ODX-L patients were classified as MP-H, yet these patients demonstrated favorable long-term outcomes. Conclusions: Despite the limitations of a small sample size, our findings suggest that for patients with node negative hormonal receptor positive breast cancer ODX predicts better prognosis and response to chemotherapy than MP. Future prospective randomized trials directly comparing different genomic assays are warranted to optimize risk stratification and treatment decisions. Breast cancer outcomes based on genomic assay risk classification. Genomic assay / outcomes ODX MP High (n = 51) Low (n = 35) High (n = 37) Low (n = 49) OS 88% 100% 92% 94% DRFS 86% 97% 89% 92% BCFI 84% 89% 87% 86%
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».