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Enregistrement W4410825526 · doi:10.1002/lsm.70031

Differentiation of Healthy Ex Vivo Bovine Tissues Using Raman Spectroscopy and Interpretable Machine Learning

2025· article· en· W4410825526 sur OpenAlexfundno aff
Soha Yousuf, Mohamed Irfan Karukappadath, Azhar Zam

Notice bibliographique

RevueLasers in Surgery and Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesYork UniversityNew York University Abu Dhabi
Mots-clésArtificial intelligenceSupport vector machineComputer scienceMachine learningConvolutional neural networkRaman spectroscopyBiomarker discoveryPattern recognition (psychology)Deep learningBiomedical engineeringChemistryMedicinePhysicsOpticsBiochemistryProteomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Integrating machine learning with Raman spectroscopy (RS) shows strong potential for intraoperative guidance in orthopedic procedures, but limited algorithm transparency remains a barrier to clinician trust. This study aims to develop interpretable machine learning models capable of accurately classifying bovine tissue types (bone, bone marrow, fat, and muscle) relevant to orthopedic surgery by identifying key Raman biomarkers to improve model transparency. METHODS: A portable RS system equipped with a 785 nm fiber-optic probe was used to collect spectral data from excised bovine tissues, including bone, bone marrow, muscle, and fat. One-dimensional convolutional neural network (1D-CNN) and support vector machine (SVM) models were developed to classify these tissue types. The Raman spectral data were divided using a sample-based, stratified splitting strategy and evaluated across 30 independent iterations. Feature importance maps were generated for both models, and matching scores were calculated to correlate significant spectral features with known Raman biomarkers. RESULTS: Through feature importance analysis and matching scores generated by the 1D-CNN and SVM models, critical Raman biomarkers-including hydroxyapatite, lipids, amino acids, and collagen-were identified as essential for distinguishing between the different bovine tissue types, providing deeper insights into their molecular differences. CONCLUSIONS: The integration of interpretable machine learning models with RS enabled accurate differentiation of bovine tissues relevant to orthopedic surgery, while enhancing model transparency through biomarker identification. Linking model predictions to biologically meaningful Raman features supports the development of RS as a reliable tool for precision-guided surgical procedures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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