MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410832260 · doi:10.1021/acs.jproteome.5c00182

Exploring the Targets of Reactive Oxygen Species and Defense against Oxidative Stress in <i>Campylobacter jejuni</i> Using a Multiomics Approach

2025· article· en· W4410832260 sur OpenAlexaff
Haruta Iitoyo, Alexander W. Rookyard, Joel A. Cain, Lok Man, Melanie Y. White, Ashleigh L. Dale, Stuart J. Cordwell

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensIONICS Mass Spectrometry (Canada)
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilUniversity of SydneyAustralian Government
Mots-clésCampylobacter jejuniOxidative stressReactive oxygen speciesCampylobacterMicrobiologyBiologyOxygenChemistryComputational biologyCell biologyBacteriaGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter jejuni is a major cause of human gastroenteritis. Pathogenesis depends on survival in reactive oxygen species (ROS) that are produced endogenously and by host phagocytes and microbiota. Label-based proteomics by LC-MS/MS quantified 1347 proteins (83.0% of the predicted proteome) in response to hydrogen peroxide (10 μM/0.5 mM) and superoxide-inducing paraquat (PQ; 2 μM/10 μM). Antioxidants including catalase (KatA) and alkylhydroperoxide reductase (AhpC), were induced, consistent with the oxidative stress response. Changes to nutrient transporters (SdaC/PutP/LctP) correlated with the intracellular abundance of substrates (serine/proline/lactate). ROS significantly elevated the abundance of the outer membrane protein Cj1170c, and Δ cj 1170c bacteria were compromised for survival in H 2 O 2 and under osmotic stress. PQ induced intracellular accumulation of threonine and homoserine, while Δ cj1170c bacteria were depleted of these metabolites. ROS targets cysteine thiols that can be irreversibly modified to sulfinic and sulfonic (SO 2 H/SO 3 H) acids. We identified 1334 Cys-SO 2 H/SO 3 H-modified peptides (867 sites in 495 proteins) using SCX negative and HILIC positive selection coupled to LC-MS/MS. Many sites were modified without exogenous H 2 O 2, suggesting that C. jejuni maintains an oxidative intracellular environment potentially related to microaerophilicity. Fe–S clusters were the primary targets of ROS. ROS trigger molecular remodeling associated with in-host growth, while overoxidizable Cys sites provide targets for redox-based antimicrobials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,841
Score d'incertitude au seuil0,282

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,239
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,104 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Proteome ResearchMême sujetSalmonella and Campylobacter epidemiologyTravaux en français237 207