Analysis of neuronal cardiolipin and monolysocardiolipin from biological samples with cyclic ion mobility mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
The mitochondrial phospholipid cardiolipin (CL) is essential for proper mitochondrial function and energy production. Cardiolipin has four distinct fatty acid tails with varying expression compositions, resulting in a highly variable tissue-specific distribution of isomer expression. Neuronal cardiolipin has a remarkable variety of subspecies and has recently been used as a biomarker to predict brain injury severity following cardiac arrest and traumatic brain injury. Multiple conditions have been associated with disordered cardiolipin remodeling, including Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Barth syndrome, and astrocytoma. The clinical relevance of cardiolipin as a biomarker and the importance of the mechanistic role of cardiolipin remodeling in disease emphasize the demand for a reliable and accurate means of the identification and quantification of cardiolipin. In this study, we outline the use of a novel method of cardiolipin analysis using cyclic ion mobility mass spectrometry (cIMS-MS) to isolate and identify cardiolipin subspecies in several biological samples. Furthermore, cIMS-MS established the composition of the cardiolipin profile by individual subspecies across biological samples under basal conditions. Monolysocardiolipin (MLCL), the precursor of mature cardiolipin and a primary diagnostic biomarker of Barth syndrome, was isolated from cardiolipin and identified. The monolysocardiolipin:cardiolipin ratio was quantified in brain samples from tafazzin-knockout (KO) mice, demonstrating accumulation of MLCL and providing direct evidence for the validity of this cIMS-MS methodology through genetic loss-of-function. The novel, multiple-pass feature of cIMS-MS enabled the isolation and amplification of less abundant cardiolipin subspecies in both standards and biological samples. This protocol enables rapid analysis of biological samples, allowing researchers to further dissect the mechanistic role of cardiolipin in injury pathology, with simplified sample preparation and reduced potential for artifact introduction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».