Influence of predictors and assembly processes in the structure of microbial communities in disturbed soil ecosystems
Notice bibliographique
Résumé
The environmental factors and assembly processes influencing microbial community structure and dynamics help with understanding the trajectories followed by these communities after disturbance or along restoration projects. This study analyzed the predictors associated with variability in microbial communities of soils that were stockpiled for later use as a reclamation substrate for post-mining sites in Alberta, Canada. We applied a null model operational framework to shed light on the assembly processes influencing β-diversity in the microbial communities of stockpiled soil in a chronosequence of 0.5 to 28 years and from 0 to 300 cm depth.. Microbial communities of disturbed and undisturbed soils were significantly different. Some of the conditions that characterized the disturbed soils (i.e., Increase in non-native plant groups and soil nutrients), were positively correlated with microbial diversity and with the microbial taxa that accounted for the difference between stockpiled and reference soils. However, only ∼1/5 of microbial community variability was explained by the environmental predictors assessed in our study. Overall, stochastic factors exerted the most important influence over community assembly processes in microbes (Bacteria, Archaea, and fungi). Homogenizing dispersal and dispersal limitation were the most important processes influencing the structure of bacterial communities, whereas the fungi were mainly governed by drift. Nevertheless, the relative influence of specific stochastic processesvaried depending on soil depth, storage time, and taxa abundance. Our results provide insights into microbial groups that may be indicators of soil disturbance and reveal that selective pressures promoted by environmental filters or legacy effects may not be as important as usually described in the literature for the structuring and variability of the microbial communities in stockpiled soils.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».