Genomic Variation Underpins Genetic Divergence and Differing Salt Resilience in <i>Sesbania bispinosa</i>
Notice bibliographique
Résumé
Halophytes possess inherent stress resilience and diverse adaptations, making them valuable genetic reservoirs for crop breeding. The leguminous halophyte Sesbania bispinosa is a valuable forage crop that thrives in saline soils. To explore its salt tolerance, high-quality genome assemblies is generated for the salt-tolerant S. bispinosa accession SbTA02 and the salt-sensitive accession SbSA44. Genomic analysis revealed that the genomic divergence between the two accessions primarily originates from their pericentromeric and centromeric regions, which contain the two largest inversions: a >27-Mb inversion on chromosome 5 and a ≈49-Mb inversion on chromosome 6. Population-level analysis revealed that the 27-Mb inversion is widespread in S. bispinosa, dividing the tested populations into inland and coastal groups. These groups have many genetic divergence regions (GDRs), with genetically isolated haplotypes in the middle section of chromosome 5, including the large inversion and centromeric regions. Genome-wide association studies (GWAS) identified significant salt-tolerance signals in the GDRs, pinpointing the anthocyanidin synthase gene SbANS. Natural variation in SbANS is associated with differences in salt tolerance between salt-tolerant and salt-sensitive S. bispinosa accessions. These findings provide insights into the genomic evolution of the Sesbania genus and shed light on how genomic variation shapes genome architecture, genetic divergence, and phenotypic differentiation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».