Characterization of the Virome in Mosquitoes Across Distinct Habitats in the Yucatán Peninsula, Mexico
Notice bibliographique
Résumé
Human activities and land use changes have a major impact on the distribution and diversity of mosquito vectors and their associated viruses. This study describes the diversity and differential abundance of viruses associated with mosquito species from four habitats of the Yucatan Peninsula, Mexico. Using next-generation sequencing (NGS), we analyzed 61 genomic libraries belonging to 20 mosquito species to characterize the viral community. A total of 16 viral species were identified, representing 14 different viral families. Most identified viruses were associated with insects, plants, and fungi. Additionally, vertebrate associated viral families, including Herpesviridae, Peribunyaviridae, Nairoviridae, and Arenaviridae, were detected in mosquitoes from urban habitats. Notably, insect-associated viruses like Hubei mosquito virus 4 and Hubei virga-like virus 2 were identified, along with the first report of Mercadeo virus in Mexico. Variations in viral community composition were primarily driven by mosquito species, with species of the same genus maintaining similar viromes despite occupying different habitats. These findings reinforce that intrinsic traits of mosquito species play a key role in shaping viral community composition. To our knowledge, this is the first study that describes the viral community in mosquitoes in Yucatan Peninsula, Mexico. This study provides essential baseline data for the surveillance of mosquitoes and associated viruses from a biodiverse tropical region that faces strong land use modifications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».