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Enregistrement W4410893654 · doi:10.1016/j.microb.2025.100401

Dynamic monitoring of Staphylococcus epidermidis biofilm formation using a microfluidic approach

2025· article· en· W4410893654 sur OpenAlexafffund
Sahra Fonseca, Jonathan Robidoux, Marie‐Pierre Cayer, Jolianne Matte, Steve J. Charette, Danny Brouard

Notice bibliographique

RevueThe Microbe · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversité LavalHéma-Québec
Organismes subventionnairesMitacs
Mots-clésBiofilmStaphylococcus epidermidisMicrofluidicsMicrobiologyStaphylococcus aureusChemistryNanotechnologyMaterials scienceBiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The crystal violet (CV) assay was the standard for quantifying biofilm biomass but is limited by its inability to replicate dynamic environmental conditions. In contrast, microfluidic flow cells provided a promising alternative, enabling real-time monitoring of biofilm development under controlled and continuously changing environments. This study evaluated the performance of different methods for assessing biofilm formation under various growth conditions, using Staphylococcus epidermidis as a model bacterium. S. epidermidis biofilms are particularly challenging in biomaterial-related infections, highlighting the need for accurate methods to assess biofilm dynamics in such contexts. Biofilm formation was evaluated using the CV assay (adapted from ISO 4768) and single-use polydimethylsiloxane (PDMS) microfluidic flow cells. These flow cells featured dual identical channels, which were individually operated by syringe pumps. In the microfluidic system, inoculum of varying concentrations and types were tested with a standard culture medium. This medium was either supplemented with 0.5% glucose or diluted 1/5 to assess its effects on biofilm development. The CV assays showed similar biofilm growth in both standard and glucose-supplemented media. However, the microfluidic system revealed that glucose was detrimental to biofilm formation. The diluted medium condition impacted biofilm formation significantly with the CV assay but had minimal effect in microfluidics. Biofilm-like structures were consistently detected using microfluidics, even under diluted or low-inoculum conditions, whereas the CV assay failed to observe them. The microfluidic approach enabled real-time biofilm monitoring, offering greater sensitivity to medium composition and inoculum effects, while the CV assay reflects static conditions where environmental changes are mediated by biofilm itself. This study highlights the importance of adopting a dynamic approach to studying biofilm growth mechanisms. The microfluidic approach presented in this study was developed for blood bank applications to contribute to advancements in knowledge on transfusion safety in hospital settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,392

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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