First report on the molecular characterization and phylogenetic analysis of Fannia sp. (Diptera: Fanniidae) identified in Türkiye
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT This study provides the first data on the molecular characterization and phylogenetic analysis of Fannia sp. specimens collected from livestock farms in Kırşehir province, Türkiye. Two molecular markers, the mitochondrial DNA COI gene and the partial region of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) gene, were used for the molecular characterization of the specimens. All COI sequences were identical, representing a single haplotype. Similarly, all ITS2 sequences were identical, representing a single genotype. The BLASTn analysis of the Turkish Fannia COI haplotype showed 100% similarity to Fannia canicularis haplotypes from Portugal, Spain, China, Finland, India, South Korea, Poland, and Canada, and to Fannia subpubescens Collin, 1958 from Finland, and Fannia sp. from Canada, suggesting these are likely F. canicularis. The COI barcode region successfully separated the Fannia species into monophyletic clusters in ML and BI analysis. Besides, the BLASTn analysis of the Turkish Fannia ITS2 genotype revealed lower similarity (64.2% - 88.4%) to ITS2 sequences from other Fannia species. These findings suggest that the mitochondrial COI barcode region is a reliable marker for differentiating the Fannia species. Further studies are needed to elucidate the genetic diversity and epidemiology of these flies in Türkiye.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».