DFT and molecular docking study of a benzastatin alkaloids: Reactivity, cyclization mechanism, and antimalarial potential against plasmodium falciparum
Notice bibliographique
Résumé
This study examines the reactivity of an intramolecular cyclization process involving benzastatin, a molecule derived from Streptomyces nitrosporeus, using density functional theory (DFT) with the B3LYP functional and the 6-311G(d,p) basis set. Parr indices, calculated by natural bond orbital (NBO) analysis, provide insight into the reactivity and chemical behavior of the system. In addition, the electron localization function (ELF) is used to analyze bond formation during the process. A molecular docking study highlights the pharmacological potential of benzastatin-derived alkaloids against Plasmodium falciparum, the malaria parasite, by targeting the key enzymes falcipain-2 and falcipain-3. The study elucidates the key interactions and binding affinities between the reaction products involved and these enzymes, supported by molecular dynamics simulations to study the stability of the ligand-protein complex over 50 ns. ADMET predictions suggest favorable pharmacokinetic profiles and low toxicity for the compounds, underlining their potential as antimalarial drug candidates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».