Plasma cell-free DNA methylome as early detection and prognostic marker for pancreatic cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Pancreatic cancer is highly fatal, with limited early detection options. Here, we conducted a study to evaluate the potential use of circulating cell-free DNA methylation for pancreatic cancer early detection and prognosis. Using a highly sensitive enrichment-based sequencing technology, we profiled genome-wide circulating cell-free methylome of 199 pancreatic cancer patients and 205 healthy individuals. We identified a panel of differentially methylated regions in cell-free DNA that distinguished pancreatic cancer cases from controls with high accuracy (test set AUC=0.93, 95%CI=0.88-0.98), notably robust accuracy for early-stage pancreatic cancer (AUC=0.92, 95%CI=0.86-0.98). We also identified a panel of cfDNA methylated regions that effectively stratified patients into longer or shorter survival groups, which was independently validated in The Cancer Genome Atlas cohort (HR=1.37, 95%CI=1.00-1.88, p=0.049). These results provide support for the potential utility of cell-free DNA methylation markers for both early detection and prognosis in pancreatic cancer, presenting a promising tool for enhancing patient management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».