Functionally distinct ALK and ROS1 fusions detected in infant-type hemispheric gliomas converge on STAT3 and SHP2 activation
Notice bibliographique
Résumé
ALK and ROS1 fusions are emerging as key drivers of infant-type hemispheric gliomas (IHG). With diverse gene partners, the impact of ALK and ROS1 oncoprotein heterogeneity on glioma biology remains unknown. We developed an integrative phospho-proteomic and transcriptomic approach to discover biological functions regulated by five IHG-associated fusions: CCDC88A::ALK, PPP1CB::ALK, GOPC::ROS1, CLIP1::ROS1 and KIF21A::ROS1 . Here, we report fusion-specific oncogenic functions conferred by the 5’ gene partner, including increased cell motility driven by microtubule-interacting fusions CCDC88A::ALK and CLIP1::ROS1 . All studied fusions converged on a non-canonical STAT3 activation. Using affinity purification mass spectrometry, we identify SHP2 in direct interaction with all three ROS1 oncoproteins, but with none of the ALK oncoproteins, which in turn interact with SHC1/SHC3. ROS1 fusions phosphorylated SHP2 to a larger extent than ALK fusions, and analyses of downstream pathways suggested MAPK-independent, non-canonical SHP2-driven functions. Our findings reveal both common and fusion-specific dependencies, offering opportunities to optimize therapeutic strategies for pediatric gliomas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».