The complete mitochondrial genome of Pleurocorallium inutile (Octocorallia: Scleralcyonacea: Coralliidae)
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Although the genus Pleurocorallium contains an economically valuable species, limited genetic information is available. Here, we report the complete mitochondrial genome sequence of Pleurocorallium inutile. In Japan, this species is known as damesango, meaning "useless coral", because it has no commercial value when caught as a bycatch during precious coral harvesting. Although several species of Pleurocorallium can be distinguished morphologically, some cannot be differentiated using the limited number of characterized genetic regions, such as eight mitochondrial and elongation factor genes. P. inutile is one such species, and therefore, analyzing its complete mitochondrial genome will be useful for identifying its phylogenetic status, distinguishing it from other commercially important species, and providing insights into the evolution of octocoral mitochondrial genes. METHODS AND RESULTS: The 18,822 bp mitochondrial genome of P. inutile consists of 14 protein-coding genes, two ribosomal RNA (rRNA) genes (rnL and rnS), and one tRNA gene (trnM). Consistent with previous studies, P. inutile shares the same gene arrangement as other Pleurocorallium species, while exhibiting distinct gene arrangements compared to closely related genera, such as Corallium and Hemicorallium. A phylogenetic tree based on protein-coding and rRNA genes from currently available Coralliidae species indicated that Pleurocorallium exhibited greater within-genus genetic distances than Corallium and Hemicorallium. CONCLUSIONS: Our study clearly distinguished P. inutile from other species using published mitochondrial genomes. This sequence information will be useful for accurate biodiversity assessments and understanding octocoral mitochondrial gene evolution in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».