Oncogenic function of growth arrest-specific transcript 5 by competing with miR-423-3p to regulate SMARCA4 in hepatocellular carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Long noncoding RNA growth arrest-specific transcript 5 (GAS5) has been identified as a tumor suppressor due to its downregulation in several cancers. However, our comprehensive analyses revealed aberrant overexpression of GAS5 in various cancers, with a direct association with SMARCA4 in hepatocellular carcinoma (HCC). Differential expression analyses were conducted using publicly available transcriptome datasets. Functional studies of GAS5 and its downstream targets in HCC were performed via small interfering RNA-mediated knockdown in various HCC cell lines, in vivo xenograft mouse models and spontaneous liver cancer models in Ras -transgenic mice. Here we discover that METTL3-mediated N 6 -methyladenosine modification promoted IGF2BP2 binding, stabilizing GAS5 in HCC. GAS5 expression was significantly upregulated in large cohort of patients with solid cancer, including HCC. Targeted disruption of GAS5 resulted in notable inhibition of growth and proliferation in HCC cells. Further analyses demonstrated that GAS5 enhanced in vitro tumorigenesis and metastatic potential of HCC cells. MicroRNA target prediction and functional validation indicated that GAS5 shared a miR-423-3p binding element with SMARCA4 messenger RNA, functioning as a competing endogenous RNA. This interaction was validated in vitro tumorigenesis assays and in vivo models. Moreover, a synergistic effect was observed with vehicle containing a small interfering RNA mixture targeting both GAS5 and SMARCA4 in these animal models. N 6 -methyladenosine-mediated IGF2BP2 binding stabilizes GAS5, which functions as a competing endogenous RNA for miR-423-3p, thereby enhancing the translation of SMARCA4 messenger RNA. GAS5 acts as a crucial regulator of the oncogenic SMARCA4 in hepatocellular carcinogenesis, presenting a potential therapeutic target for the treatment of liver malignancies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».