MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410941324 · doi:10.1101/2025.06.01.25327945

Advancing Genotype-Phenotype Analysis through 3D Facial Morphometry: Insights from Cri-du-Chat Syndrome

2025· preprint· en· W4410941324 sur OpenAlexaff
Michiel Vanneste, Harold Matthews, Yoeri Sleyp, Peter Hammond, Mark D. Shriver, Seth M. Weinberg, Mary L. Marazita, Susan Walsh, Benedikt Hallgrímsson, Ophir D. Klein, Richard A. Spritz, Kris Van Den Bogaert, Peter Claes, Hilde Peeters

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalAlberta Bone and Joint Health InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthVlaamse regeringKU LeuvenNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchPennsylvania State UniversityIndiana University-Purdue University IndianapolisUniversity of PennsylvaniaFonds Wetenschappelijk OnderzoekU.S. Department of Defense
Mots-clésPhenotypeBiologyGenotypeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: Facial dysmorphism is a feature of many monogenic disorders, and is important in diagnostics, variant interpretation and nosology. Nevertheless, comprehensively assessing the complex facial shape changes associated with specific syndromes remains challenging. Here, we present 3D morphometric approaches to overcome these limitations, utilizing Cri-du-Chat syndrome (CdCS) as a model. Methods: We analyzed 3D facial photos from 24 individuals with CdCS, 4540 unaffected controls and 5 individuals with rare 5p15.33-15.32 deletions, incorporating two methods to account for age- and sex-related facial variation. We quantified phenotypic variation within and between groups and explored genotype-phenotype correlations in CdCS. Results: We identified changes in the characteristic facial features of CdCS with age and found that facial shape in CdCS differed from controls in highly consistent directions, but with varying magnitudes of effect. 5p15.33-15.32 heterozygotes had non-specific dysmorphic features that were objectively different from those in CdCS, delineating multiple critical regions for facial dysmorphism on chromosome 5p. Conclusion: This work explores 3D facial morphometry to complement the standard clinical assessment of facial dysmorphism. It provides insights into the genetic basis of facial shape in CdCS and highlights the potential of 3D morphometric techniques to facilitate clinical diagnostics, variant interpretation, and delineation of syndrome nosology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxivMême sujetGenomic variations and chromosomal abnormalitiesTravaux en français237 207