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Enregistrement W4410944213 · doi:10.1002/btpr.70046

A recurrent neural network for soft sensor development using <scp>CHO</scp> stable pools in fed‐batch process for <scp>SARS</scp>‐<scp>CoV</scp>‐2 spike protein production as a vaccine antigen

2025· article· en· W4410944213 sur OpenAlexafffund
Sebastian‐Juan Reyes, Robert Voyer, Yves Durocher, Olivier Henry, Phuong Lan Pham

Notice bibliographique

RevueBiotechnology Progress · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensPolytechnique MontréalNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChinese hamster ovary cellBioreactorTiterComputer scienceBiological systemChemistryBiologyBiochemistryImmunologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fed‐batch recombinant therapeutic protein (RTP) production processes utilizing Chinese Hamster Ovary (CHO) cells can take a long period of time (&gt;10 days). Within this period, not all critical features may be measured routinely, and in fact, some are only measured once the process is terminated, complicating decision making. As a consequence, utilizing routine current day bioreactor online data to aid in next day predictions is a promising strategy for model predictive control‐based feeding strategies. The article details the development of a proposed soft sensor that merges current day bioreactor online data and offline historical sampling data to generate predictions about the next day of the production process. This approach demonstrated the ability to track product titer, cell growth, key metabolites, and cumulative glucose consumption across the 17‐day process with low normalized root mean squared error (nRMSE = 0.24) and low normalized mean absolute error (nMAE = 0.18) as well as high linearity with respect to ground data (average R 2 = 0.97). It was also demonstrated that the same model architecture could effectively soft sense product titer and metabolic profiles (glucose, lactate, ammonia) without having sampling day's offline data as inputs to the model. This suggests that the proposed model could act as a true soft sensor of hard‐to‐determine variables such as the trimeric SARS‐CoV‐2 spike protein that relies on end‐of‐process measurements to acquire the data (labor‐intensive semi‐quantitative SDS‐PAGE gels or ELISA assay). Instantaneous specific glucose consumption rates were also predicted and showed good agreement with experimental measurements, further offering opportunities for online glucose control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,115
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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