Assessing changes to the fecal microbiota in dogs undergoing elective orthopedic surgery: A preliminary investigation
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Studies assessing the impact of surgery on the canine gut microbiota are limited. This study assessed the fecal microbiota before and up to 3 months after elective orthopedic surgery. METHODS: Fourteen client-owned dogs >1 year of age undergoing elective orthopedic surgery were recruited. Dogs received perioperative antibiotics only (perioperative cefazolin, n = 7) or were discharged with oral cephalexin following surgery for 5-7 days (n = 7) in conjunction with perioperative antibiotics. Fecal samples were collected at baseline and at recheck 1 (13-50 days post-operatively) and recheck 2 (55-90 days post-operatively). The fecal microbiota was analyzed using 16S amplicon sequencing. Alpha diversity was assessed with the Sobs Index, Shannon Diversity Index, and Inverse Simpson Index, whereas beta diversity was assessed with the Bray-Curtis Index and Jaccard Index. RESULTS: In the perioperative and post-operative antibiotic groups, the Inverse Simpson and Shannon Diversity Index differed between baseline and recheck 1 (p < 0.05), baseline and recheck 2 (p < 0.05), but not between recheck 1 and recheck 2 (p > 0.05). The Sobs Index was only significantly different between baseline and recheck 1 (p = 0.02) in both groups. The Bray-Curtis and Jaccard Index were significantly different at rechecks 1 and 2 compared to baseline (p > 0.05) in the post-operative antibiotic group but not in dogs that received only perioperative antibiotics. Both the Bray Curtis and Jaccard Index were significantly different between the antibiotic prescription types (p = 0.001) although measures of alpha diversity were not (p > 0.05). CONCLUSIONS: Alterations in community structure, richness, and diversity were identified in dogs undergoing elective orthopedic surgery, with many changes persisting at least 2-3 months post-operatively in dogs receiving perioperative and/or post-operative antibiotics.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».