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Enregistrement W4410966579 · doi:10.36899/japs.2025.3.0075

DNA BARCODING AND PHYLOGENETIC RELATIONSHIP OF RAY-FINNED FISH FAMILY SERRANIDAE (GENUS EPINEPHELUS) FROM THE COAST OF GWADAR BALUCHISTAN

2025· article· en· W4410966579 sur OpenAlexaboutno aff
Rukhsana Kausar, Amin Ullah Kakar, Manal E. Shafi, Dost Muhammad Baloch, Faiz Muhammad, Andri Sanityoso Sulaiman, A Saddozai, Asfand yar

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Animal and Plant Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFish Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerranidaeEpinephelusDNA barcodingBiologyPhylogenetic treeGenusFish <Actinopterygii>ZoologyFisheryGrouperGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA barcoding is inevitable for identification and effectively replacing the traditional pattern of species taxonomy around the world. Species of the family Serranidae are commercially important and play a vital role in Pakistan economy. This family is in high demand in both domestic and international markets due to its white, tender, and flavorful meat, as well as its appealing texture, generating significant revenue. Many species exhibit close morphological characteristics, leading to confusion in accurate identification. The objectives of present study are to identify the grouper species based on morphological and molecular approaches. Epinephelus fish samples were collected with the assistance of local fisherman from the coast of Gawadar, Baluchistan. Besides the morphological identification approaches, the barcoding method became an integral tool for identification in by years and it replacing the traditional taxonomic approaches worldwide. In present study we became successful to identify the four species of Epinephelus, however the genetic distance revealed a diversity range of 0.00 to 0.19. Furthermore, the phylogenetic analysis detailed the close relationship between the species from China, Iraq, Iran, Malaysia, Bangladesh, India, Qatar, Saudi Arabia, Thailand, Canada and Tehran. Key words: DNA barcoding, Phylogenetic relationship, Epinephelus, N.J. (neighbor joining), Kimura distance, Gwadar

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,261
Score d'incertitude au seuil0,416

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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