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Enregistrement W4411000427 · doi:10.1111/nph.70272

Stereochemical insights into sarpagan and akuammiline alkaloid biosynthesis

2025· article· en· W4411000427 sur OpenAlexafffund
S. G. MANN, Melina Paz‐Galeano, Mohammadamin Shahsavarani, Jacob Owen Perley, Guo Jun, Jorge Jonathan Oswaldo Garza-García, Yang Qu

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2025
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueAlkaloids: synthesis and pharmacology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNew Brunswick Innovation Foundation
Mots-clésVindolineAldehyde oxidaseCatharanthus roseusStereochemistryEnzymeBiosynthesisBiochemistryCytochrome P450MonooxygenaseAlkaloidBiologyAldehydeChemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sarpagan and akuammiline monoterpenoid indole alkaloids (MIAs) are a class of bioactive plant-derived compounds with significant pharmaceutical potential. These alkaloids are formed through oxidative cyclization of geissoschizine, catalyzed by homologous cytochrome P450 monooxygenases (CYP) known as sarpagan bridge enzymes (SBEs) and rhazimal synthases (RHSs). However, a long-standing discrepancy exists between the expected C16 stereochemistry of enzymatic products and the stereochemistry of naturally occurring derivatives. This study investigates C16 stereochemistry outcomes after geissoschizine cyclization and subsequent enzymatic transformations in six MIA-producing species. We combine comparative gene discovery, in planta gene silencing of Catharanthus roseus SBE, in vitro enzyme characterization, and intermediate nuclear magnetic resonance analysis. We identify and characterize five new CYPs and a new akuammidine aldehyde reductase alongside two known enzymes from Alstonia scholaris, Amsonia tabernaemontana, Catharanthus roseus, Rauvolfia serpentina, Tabernaemontana elegans, and Vinca minor. RHS enzymes consistently produce the 16R rhazimal stereoisomer. SBEs likely yield 16R polyneuridine aldehyde and, to a lesser extent, its 16S epimer akuammidine aldehyde. Downstream aldehyde reductases, deformylases, and decarbomethoxylases further epimerize C16, generating species-specific stereochemical diversity. This work demonstrates the enzymatic tailoring steps that govern C16 stereochemistry in sarpagan MIA biosynthesis, offering new insight into stereochemical diversification and pathway evolution in plant specialized metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,446
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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