MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4411011219 · doi:10.1016/j.jbc.2025.110341

Interactome of FMRP-N-tat therapeutic unveils key interactions for cellular function in Fragile X neurons

2025· article· en· W4411011219 sur OpenAlexafffund
Kévin Leguay, Mariana Acevedo, Eva Colic, Preya U. Patel, Saeideh Shamsi Kazem Abadi, Helen LB. Chan, Sharon Sun, Daneck Lang-Ouellette, Benny K. K. Chan, Xiaoqin Zhan, Ray W. Turner, Joseph A. Mancini, Oliver A. Kent

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensHotchkiss Brain InstituteUniversity of CalgaryFPInnovations
Organismes subventionnairesUniversity of Calgary
Mots-clésInteractomeKey (lock)Cell biologyFunction (biology)Fragile xBiologyChemistryComputational biologyNeuroscienceGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Therapeutic protein replacement has demonstrated preclinical and clinical efficacy in neurological disorders but has not been used clinically for Fragile X syndrome (FXS), a genetic neurodevelopmental disorder caused by loss of Fragile X messenger ribonucleoprotein (FMRP). FXS results from a triplet repeat expansion of more than 200 CGG repeats in the 5'-UTR of the FMR1 gene leading to epigenetic silencing of FMRP. Currently, no clinically approved disease-modifying treatments for FXS exist. Recently, a tat-conjugated FMRP fragment encompassing residues 1 to 297 (FMRP N-tat) was shown to restore aspects of neuronal function in a mouse model of FXS. Promising in vivo data hinted to the therapeutic potential of FMRP N-tat. Herein, affinity purification mass spectrometry was used to identify the FMRP N-tat interactome in tsA-201 FMR1 knockout cells and FXS patient iPSC-derived neurons. The FMRP N-tat interactome included RNA binding proteins and constituents of the ribosome, which aligned closely with the known functions of FMRP. Further, the FMRP N-tat associated proteins included FXR2, STAU1, TRIM28, C1QBP, VDAC2, and several ribosomal proteins to regulate mRNA stability, cellular stress responses, mitochondrial function, and translation. The results highlight the potential of FMRP N-tat to orchestrate assembly of factors to correct lost function in FMRP deficient cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetGenetics and Neurodevelopmental DisordersTravaux en français237 207