Interactome of FMRP-N-tat therapeutic unveils key interactions for cellular function in Fragile X neurons
Notice bibliographique
Résumé
Therapeutic protein replacement has demonstrated preclinical and clinical efficacy in neurological disorders but has not been used clinically for Fragile X syndrome (FXS), a genetic neurodevelopmental disorder caused by loss of Fragile X messenger ribonucleoprotein (FMRP). FXS results from a triplet repeat expansion of more than 200 CGG repeats in the 5'-UTR of the FMR1 gene leading to epigenetic silencing of FMRP. Currently, no clinically approved disease-modifying treatments for FXS exist. Recently, a tat-conjugated FMRP fragment encompassing residues 1 to 297 (FMRP N-tat) was shown to restore aspects of neuronal function in a mouse model of FXS. Promising in vivo data hinted to the therapeutic potential of FMRP N-tat. Herein, affinity purification mass spectrometry was used to identify the FMRP N-tat interactome in tsA-201 FMR1 knockout cells and FXS patient iPSC-derived neurons. The FMRP N-tat interactome included RNA binding proteins and constituents of the ribosome, which aligned closely with the known functions of FMRP. Further, the FMRP N-tat associated proteins included FXR2, STAU1, TRIM28, C1QBP, VDAC2, and several ribosomal proteins to regulate mRNA stability, cellular stress responses, mitochondrial function, and translation. The results highlight the potential of FMRP N-tat to orchestrate assembly of factors to correct lost function in FMRP deficient cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».